大规模的动物饲养会对饮用水造成问题，因为动物粪便中含有的硝酸盐成分会对地下水构成污染。欧盟委员会指责德国政府到目前为止少有行动解决这一问题，因此对德国政府提起诉讼。
今年4月欧盟委员会曾警告德国政府，应该采取措施解决地下水受污染的问题，否则欧盟将向欧洲法院起诉德国政府。现在德国可能需要为此交纳罚金。
欧盟在起诉书中指出，按照欧盟相关规定，德国各联邦州以及地方政府应该最晚到2012年加强对防止地下水遭受污染的规范和条例。德国地下水因农业和畜牧业制造出的硝酸盐成分而受到污染。
德国环保部指出，德国境内三分之一的地下水硝酸盐污染情况严重。按照规定，每一升地下水中的硝酸盐含量不应该超过50毫克，但是德国很多地区都严重超标。
无论对于人类还是环境，水中含有硝酸盐都是一个问题。因为硝酸盐会转变为容易引发癌症的亚硝酸盐。另外硝酸盐会在大海和海岸边催生出大量的海藻。海藻泛滥会导致大量水生动物死亡。
德国地下水硝酸盐污染的情况也在逐年增加。专家们担心，硝酸盐在地下水中含量超标的问题恐怕在未来几年不会得到缓解。粪肥中的硝酸盐成分通过耕地表面渗透进地下水的过程往往长达10年之久。
问题存在已久
欧盟范围内地下水硝酸盐污染问题最为严重的国家是马耳他和德国。这一污染问题形成的主要原因是大规模畜牧养殖。德国境内养殖的生猪数量超过2700万头，肉牛、奶牛数量达到1300万。另外再加上邻国荷兰和丹麦境内养殖的动物，这些动物的粪便最终落在农田上。
而实际上只有一部分经济作物适用于施加生物粪肥。环境与发展组织德国观察的农业问题专家贝宁（Reinhild Benning）解释说：“问题是牲畜的数量太多，而农田数量太少。”大量多余的肥料渗入了地表水层和地下水层。
而这一切造成的危险也是显而易见的。一些地区的自来水厂表示，过不了多久就将无法提供足够的未受污染的饮用水。地方企业联合会负责人莱赫（Katherina Reiche）说：“我们这一代和下一代都需要保护饮用水安全的有效政策。”
由于地下水遭受污染，自来水供应在技术层面越来越复杂，成本也越来越高。德国联邦环保局估测，今后自来水水价有可能会上涨50%。
欧盟控告德国政府不作为
为了防止农业畜牧业制造的硝酸盐污染地表水和地下水，同时也为了改善欧洲水质，欧盟国家一同达成签订了“硝酸盐规范指南”。这项规范指南要求欧盟所有国家都采取相应的保护措施。
欧盟委员会认为德国未能在防止地下水硝酸盐污染的问题上采取严格措施而将德国告上欧洲法院。德国社民党议会党团农业问题专家普利斯迈尔（Wilhelm Priesmeier）警告说，现在德国有可能会面临需接受高达数亿欧元罚金的惩罚。
数年来，科学界和政界的专家们一直呼吁制定严格的规范，加强监控并对违反规定的企业实施处罚，这样才能最终解决德国境内农田过度施肥以及连带造成地下水受污染的问题。
其中一项有效的措施是让农业经营者们都记录粪肥的使用量，这样可以终止过度施肥。如果有人在记录中作假，一旦被发现就要面临惩罚。在解决过度施肥问题以及保护地下水方面成绩优异堪称典范的国家是丹麦、法国和荷兰。
