在最初的仲裁诉求中，菲律宾并没有要求仲裁庭就台湾实际控制的太平岛（Itu Aba）是岩礁还是岛做出裁决。但是，随着案子的推进，也因为台湾的努力，太平岛越来越进入公众的视野。有分析人士指出，太平岛的地位可能会使局势发生逆转。有最新报道说，因为台湾向仲裁庭提交了太平岛地位的相关证据，仲裁庭可能会把宣布裁决结果的日期推迟到6月甚至7月。
菲律宾起先要求仲裁庭裁定中国在斯普拉特利群岛（南沙群岛）控制的若干地物是否可以产生专属经济区或是大陆架。这些地貌包括黄岩岛（Scarborough Shoal），美济礁（Mischief Reef）、仁爱礁（Second Thomas Shoal ）、渚碧礁（Subi Reef）等，但是并没有太平岛。
但是，在第二阶段的实体审议中，仲裁庭要求菲律宾对台湾实际控制的太平岛地位作出解释，因为菲律宾必须能证明在中国在南沙群岛控制的其他地物也不能产生专属经济区或是大陆架。中国视台湾及太平岛为其固有领土，而菲律宾承认一个中国的原则，所以菲律宾必须回答太平岛的问题。
中国在2014年的立场文件中也特别指出了这一点：“菲律宾海刻意将中国台湾驻守的南沙群岛最大的岛屿--太平岛排除在‘中国占领或是控制’的岛礁之外，严重违反了一个中国的原则，侵犯了中国的主权和领土完整。”
菲律宾：太平岛是“岩礁”
在2015年11月24日到30日的第二阶段的口头听审中，菲律宾宣称中国在南沙控制的所有岛礁一部分为低潮高地，另外一部分为“岩礁”。而台湾控制的太平岛是“岩礁”而非“岛屿”，不得享有超过12海里的海洋权利。
菲律宾律师团的首席美国律师保罗·雷切勒（Paul Rechler）在回答仲裁员的提问时说，斯普拉特利群岛的所有在涨潮时高于水面的陆地区域，包括最大的太平岛和中业岛（Thitu）都是“岩礁”，中业岛目前被菲律宾控制。
他说：“这两个地物都无法维持人类居住或维持本身的经济生活，因此都是‘岩礁’，不能享有专属经济区或是大陆架。你甚至不需要海洋划界方面的知识，或是任何跟海洋划界有关的东西来得出结论。”
新美国安全中心的亚洲问题专家米拉·拉普-胡珀（Mira Rapp-Hooper）说：“把上述地物，（包括太平岛）都裁定为岩礁，是符合菲律宾的持久利益的。如果斯普拉特利群岛上的所有地貌都只能享有不超过12海里的领海权，那就意味着从菲律宾主岛延伸出的专属经济区就不会与别人共享。”
如果太平岛是岩礁，太平岛就无法划定200海里的专属经济区，菲律宾巴拉望岛可以向外衍生200海里的经济海域，菲律宾在这个海域内可以享有专属的油气勘探、渔业开发、建造人工岛屿和采矿等主权权利，因此，中国等其他国家在此区域内的资源开发和人工岛屿将全属非法。
据称，菲律宾在递交给仲裁庭的附件中甚至用台湾控制的中洲礁的照片替代太平岛照片，以示太平岛是“礁”不是“岛”。中洲礁是距离太平岛约3海里的一个岩礁，涨潮时，只比一个篮球场大一点。
根据《联合国海洋法公约》的定义，岛屿为四面环水，在涨潮时高于水面自然形成的陆地区域且可维持人类居住或本身经济生活，可拥有领海、大陆架以及专属经济海域。而岩礁只能有12海里的领海权。
台湾：太平岛是“岛屿”
菲律宾在仲裁庭上的一系列表述自然引发了台湾的不满。2015年12月开始，台湾当局还在太平岛采取了一系列措施，先后派出高级官员和各类专家登岛，论证太平岛是“岛屿”，绝非“岩礁”。
今年1月底，台湾总统马英九亲自前往太平岛巡视，并发表讲话，强调太平岛是“岛屿”而非“岩礁”，马英九此举后来遭到台湾盟友美国的批评。马英九说，菲律宾对太平岛表现出无知，用荒谬的理由误导仲裁员。
3月份，台湾还邀请美联社、法新社、路透社、彭博社，日本共同社等国际媒体赴太平岛考察，宣示对太平岛的主权。后来，台湾又邀请国际知名学者前往太平岛考察。
4月，马英九还曾邀请菲律宾和国际仲裁法庭法官到太平岛实地考察，以确认太平岛的法律地位。不过，菲律宾已经拒绝邀请，仲裁庭还没有做出回应。
不过，台湾早在2015年7月7日，也就是仲裁庭第一次开庭就仲裁庭的管辖权进行辩论之前，就发表了《中华民国对南海问题之立场声明》。声明花了很大的篇幅叙述太平岛符合维持人类居住及其本身经济生活之要素，强调太平岛是岛屿，绝非岩礁。
声明说，中华民国在1956年派兵驻守南沙群岛中面积最大（约0.5平方公里）之自然生成岛屿－太平岛，并于同年在该岛设置南沙守备区。1990年2月，中华民国行政院核定由高雄市政府代管太平岛，行政管辖属高雄市旗津区。
声明还说，在过去60年间，中华民国军民充分利用及开发太平岛上之天然资源，以便驻留该岛完成其各自之任务。岛上除有出产地下水之水井及天然植被外，亦蕴含磷矿及渔业资源，岛上驻守人员更在该岛种植蔬果及豢养家禽家畜，以应生活所需。声明说，太平岛上甚至建有观音堂，满足岛上居民的宗教信仰需要。
2015年10月31日，台湾外交部针对仲裁庭的初步裁决发表的声明中也提到：太平岛属于《公约》上得以主张专属经济海域的岛屿。
在第二次辩论时，菲律宾律师还特别提到台湾的主张并不能算成是中华人民共和国的主张。
太平岛是岛，将涉及海洋划界
很多国际观察人士也认定太平岛是岛屿。美国国际贸易和政治风险评估公司萨缪尔斯国际合伙人机构高级研究助理索拉布·古普塔（Sourabh Gupta）先前在接受美国之音采访时说，因为太平岛是岛屿，仲裁庭可能无法走到裁决这一步。
他说：“仲裁庭是走不了那么远，做出裁决，因为这些岛屿属于中国所宣称拥有主权的一个大岛的专属经济区的一部分。这是一个完整的岛屿，那是太平岛（Itu Abu Island）。”
古普塔解释说，根据《公约》的标准，太平岛是百分之百的岛屿，因此可以划定200海里的专属经济区。这样一来，就与菲律宾巴拉望岛的专属经济区将重叠，因而产生划界问题。2006年，中国将海洋划界排除出适用仲裁范围，因此将造成仲裁法院对此案无管辖权。
不过，中国在华盛顿设立的智库中美研究中心执行主任洪农说，虽然如此，仲裁庭在最后裁决时可能不会提到太平岛。
太平岛的经济专属区不会很大
不过，美国海军战争学院国际法教授詹姆斯·克拉斯卡（James Kraska）说，就算太平岛可能是中国宣称拥有的岛礁中唯一可以产生专属经济区的岛屿，但是太平岛享有的专属经济区与菲律宾岛屿享有的专属经济区的面积是无法相比的。
根据《联合国海洋法公约》，领海划定的原则包括人口比例原则和海岸线长度比例等原则，太平岛的人口与菲律宾居住着将近百万人口的巴拉望岛（Palawan）或是吕宋岛（Luzon）根本无法相比，而且，太平岛的海岸线与菲律宾岛屿的海岸线长度也无法相比。
太平岛地位可能会延迟仲裁裁决
另据台湾“中央社”消息，菲律宾最高法院大法官卡皮奥（Antonio Carpio）5月16日晚在GMA电视台政论节目中说，由于台湾向仲裁法庭提交太平岛立场书，致使菲方再于4月22日回应台方的立场，这段过程拖延了仲裁法庭宣判结果的时间。
卡皮奥说，“仲裁法庭现在可能要等到6月、甚至7月才会宣布结果。”这位法官是菲方南中国海仲裁案法律团队成员之一。原定的宣布裁决的时间是五月底或是六月中旬。
